Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms