Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms