Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms