Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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NgfrQ9Z0W1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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NgfrQ9Z0W1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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NgfrQ9Z0W1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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NgfrQ9Z0W1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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NgfrQ9Z0W1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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NgfrQ9Z0W1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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NgfrQ9Z0W1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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NgfrQ9Z0W1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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NgfrQ9Z0W1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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NgfrQ9Z0W1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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NgfrQ9Z0W1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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NgfrQ9Z0W1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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NgfrQ9Z0W1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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NgfrQ9Z0W1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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