Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms