Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib1Q9Z0F4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms