Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbp2Q9Z0E6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp2Q9Z0E6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms