Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms