Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srd5a3Q9WUP4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms