Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms