Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms