Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp1Q9WTX5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms