Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spo11Q9WTK8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms