Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam50bQ9WTJ8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms