Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms