Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf103Q9R1W3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf103Q9R1W3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms