Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NrkQ9R0G8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NrkQ9R0G8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms