Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zeb2Q9R0G7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zeb2Q9R0G7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zeb2Q9R0G7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zeb2Q9R0G7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zeb2Q9R0G7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zeb2Q9R0G7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zeb2Q9R0G7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zeb2Q9R0G7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zeb2Q9R0G7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zeb2Q9R0G7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zeb2Q9R0G7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms