Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms