Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms