Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms