Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Nek3Q9R0A5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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