Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nubp2Q9R061 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nubp2Q9R061 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nubp2Q9R061 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nubp2Q9R061 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nubp2Q9R061 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nubp2Q9R061 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nubp2Q9R061 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nubp2Q9R061 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nubp2Q9R061 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nubp2Q9R061 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nubp2Q9R061 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nubp2Q9R061 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nubp2Q9R061 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nubp2Q9R061 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nubp2Q9R061 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nubp2Q9R061 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nubp2Q9R061 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nubp2Q9R061 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nubp2Q9R061 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms