Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp1Q9R060 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nubp1Q9R060 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nubp1Q9R060 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nubp1Q9R060 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nubp1Q9R060 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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