Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms