Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms