Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms