Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms