Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms