Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nphp1Q9QY53 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms