Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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