Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms