Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apbb1Q9QXJ1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apbb1Q9QXJ1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apbb1Q9QXJ1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apbb1Q9QXJ1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apbb1Q9QXJ1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apbb1Q9QXJ1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apbb1Q9QXJ1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apbb1Q9QXJ1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apbb1Q9QXJ1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apbb1Q9QXJ1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apbb1Q9QXJ1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apbb1Q9QXJ1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apbb1Q9QXJ1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apbb1Q9QXJ1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms