Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms