Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms