Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms