Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cln8Q9QUK3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cln8Q9QUK3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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