Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms