Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms