Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gkap1Q9JMB0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gkap1Q9JMB0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gkap1Q9JMB0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gkap1Q9JMB0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gkap1Q9JMB0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gkap1Q9JMB0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gkap1Q9JMB0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gkap1Q9JMB0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gkap1Q9JMB0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gkap1Q9JMB0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gkap1Q9JMB0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gkap1Q9JMB0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms