Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms