Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms