Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms