Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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