Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms