Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Nectin3Q9JLB9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Nectin3Q9JLB9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Nectin3Q9JLB9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin3Q9JLB9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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