Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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