Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AatfQ9JKX4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AatfQ9JKX4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AatfQ9JKX4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AatfQ9JKX4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AatfQ9JKX4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AatfQ9JKX4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AatfQ9JKX4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AatfQ9JKX4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AatfQ9JKX4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AatfQ9JKX4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AatfQ9JKX4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AatfQ9JKX4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms