Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms