Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx5Q9JKQ4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms